基因是生命的密码，它决定了我们的外貌、性格、健康等诸多方面。对于孙子有多少基因来自爷爷，以及 2000 年前我们祖先的基因是否还在我们身体里的问题，我们需要从基因的遗传规律和演化过程来探讨。

首先，基因的遗传是通过父母传递给子代的。在遗传过程中，父母各自贡献一半的基因给子代，这些基因在子代的身体中重新组合，形成了子代独特的基因组合。因此，孙子的基因来自父母双方，而爷爷的基因则是通过父亲传递给孙子的。

然而，具体孙子有多少基因来自爷爷是一个复杂的问题。因为基因的传递是随机的，而且在遗传过程中还可能发生基因突变等变化。此外，人类的基因数量非常庞大，每个基因对个体的影响程度也不同。因此，无法简单地确定孙子有多少基因直接来自爷爷。

不过，我们可以肯定的是，爷爷的基因在孙子的身体中是存在的。即使经过多代的传递，一些基因仍然可能被保留下来。这是因为基因的遗传是一个连续的过程，每一代都会从上一代继承部分基因。虽然随着时间的推移，基因可能会发生一些变化，但某些基因的特征仍然可能在后代中显现。

那么，对于 2000 年前我们祖先的基因是否还在我们身体里的问题，答案也是肯定的。基因的演化是一个漫长的过程，它受到自然选择、突变、遗传漂变等多种因素的影响。在演化过程中，一些基因可能会逐渐消失，而另一些基因则可能被保留并传递给后代。

尽管经过了 2000 年的时间，我们的身体中仍然可能保留着一些与祖先相同或相似的基因。这些基因可能与我们的基本生理特征、疾病易感性、行为习惯等有关。例如，一些人类基因的变异与古代人类的迁徙和适应环境有关，这些基因可能在现代人类中仍然存在。

然而，需要指出的是，2000 年的时间里，环境和生活方式的变化可能对基因的表达和功能产生影响。基因与环境之间的相互作用非常复杂，相同的基因在不同的环境中可能会有不同的表现。因此，即使我们继承了祖先的基因，它们的具体表现也可能受到现代环境和生活方式的调节。

此外，人类的基因库是不断变化和演化的。随着时间的推移，新的基因突变和基因流的发生可能会导致基因的多样性增加。因此，我们的基因组成也在不断地变化和适应着环境的变化。

总之，孙子身上的基因来自父母双方，其中可能包含爷爷的一部分基因。而 2000 年前祖先的基因在我们身体里仍然可能存在，但它们的表达和影响受到多种因素的调节。基因的传承和变化是一个复杂而动态的过程，它不仅影响着我们的个体特征，也见证了人类演化的历程。对基因的研究不仅有助于我们了解自身的遗传特征，还有助于医学、生物学等领域的发展，为人类健康和福祉做出贡献。